El protagonista de la serie es Kimihiro Watanuki, un estudiante de instituto que esta constantemente asediado por monstruos, fantasmas y espiritus que se sienten atraidos magicamente hacia el. Estos monstruos son invisibles para las personas sin poderes, por lo que los demas lo tachan de extrano o loco cuando es asediado por los espiritus. Todo cambia cuando entra en una tienda en la que venden deseos. La tienda pertenece a la atractiva Yūko Ichihara,una poderosa bruja del Japon actual. Ofrece a Watanuki la posibilidad de que deje de ver los fantasmas y criaturas si paga un precio de igual valor que la energia que ella requiere para realizar dicha labor. Watanuki al vivir solo, pues sus padres murieron en un accidente muchos anos atras, no tiene dinero,pero Yuko le ofrece encargarse de las labores domesticas de la tienda asi como del ocasional trabajo extra, hasta haber trabajado lo suficiente para concederle su deseo.