Naruto, un aprendiz de ninja de la Aldea Oculta de Konoha, es un chico travieso que desea llegar a ser el Hokage de la aldea para demostrar a todos lo que vale. Lo que descubre al inicio de la historia es que la gente le mira con desconfianza, porque en su interior esta encerrado el demonio Kyubi, un zorro de 9 colas, que una vez destruyo la aldea, y que el anterior lider de la misma tuvo que encerrar en su cuerpo siendo aun muy pequeno, a coste de su vida. Aunque sus companeros no saben esto, tampoco le aprecian porque es mal estudiante y siempre esta haciendo bromas. Sin embargo, la forma de actuar y la determinacion de Naruto demuestran a los demas que puede llegar muy lejos, y el recelo de los otros chicos se va disipando. Naruto y sus companeros Sakura y Sasuke, junto a su maestro Kakashi tendran que enfrentarse a una serie de combates y misiones a lo largo de la historia que les permitiran mejorar y crecer. Naruto se vera enfrentado a sus principales enemigos Akatsuki, Itachi y Kisame.